สโมสรฟุตบอลทวีวัฒนา ยังไม่เคยผ่านรอบแรก ในการแข่งขันฟุตบอลถ้วยของสมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทย ทั้งในรายการไทยเอฟเอคัพ และ โตโยต้า ลีกคัพ โดยสโมสรลงแข่งขันรายการเอฟเอคัพ เป็นครั้งแรก ในฤดูกาล 2557 และตกรอบแรกด้วยการออกไปแพ้ให้กับตรัง เอฟซี 3–1 เมื่อวันที่ 19 มีนาคม พ.ศ. 2557

ต่อมาสโมสรได้ลงแข่งขันในรายการโตโยต้า ลีกคัพ เป็นครั้งแรกเมื่อวันที่ 31 มกราคม พ.ศ. 2558 โดยแพ้ในรอบเพลย์ออฟ (ภาคกลางและตะวันออก) รอบแรกให้กับฉะเชิงเทรา เอฟซี 1–3 ที่สนามกีฬาสถาบันการพลศึกษา วิทยาเขตชลบุรี